Ingénieur « Conception de bases de données images et évaluation d’algorithmes d’IA »

Description du poste et des missions

Le Centre d’Investigation Clinique – Innovation Technologique (www.cic-it.fr/cic-it-grenoble.php) est une structure de recherche du CHU Grenoble-Alpes. Sa mission est centrée sur l’évaluation des technologies de santé innovantes dont par exemple les dispositifs médicaux dans le domaine des interventions augmentées en médecine. L’objectif est d’estimer le service médical effectivement rendu par ces nouveaux dispositifs à l’aide de données issues de recherches cliniques, de données issues du soin, ... Dans le cadre de ses missions, le CIC-IT participe à des projets de recherche financés, en particulier, par la région. Cette structure est amenée ainsi à travailler en étroite collaboration avec des laboratoires de recherche et des industriels du domaine des Gestes Médico- Chirurgicaux Assistés par Ordinateur (GMCAO). Dans ce contexte, le CIC-IT de Grenoble cherche à renforcer ses compétences en développement logiciel.

Ce poste s’intègre dans un projet de recherche et développement d’un robot chirurgical incorporant des technologies de traitement d’image par des algorithmes d’IA. Il se déroulera en partenariat avec deux start-ups Grenobloises à l’origine des technologies d’IA et de robotique. Un objectif majeur est la première intégration d’une IA médicale au sein d’un système de planification de robotique chirurgicale pour les interventions sur le rachis. Pour cela, les données de Santé disponibles au sein de l’Entrepôt de Données de Santé (EDS) PREDIMED du CHU Grenoble Alpes (CHUGA) devront permettre la caractérisation de la population présentant une indication de chirurgie du rachis dégénératif avec évaluation secondaire des performances de l’algorithme d’IA sur les données extraites de PREDIMED.

Domaines d’activité : 

Traitement d’image, bases de données massives, imagerie médicale, informatique médicale

Missions

Dans ce contexte, les missions de l’agent sont :

• Caractériser la population de patients traités pour une indication de rachis dégénératif au CHUGA au moyen de l’EDS PREDIMED, puis sur le marché EU et US.


• Enrichissement du jeu de données d’images d’entraînement pour qu’il réponde aux caractéristiques identifiées précédemment grâce à l’EDS PREDIMED.


• Création de datasets d’entrainement et de test répondant à ces caractéristiques.


• Analyse de l’état de l’art en matière de qualité d’annotation d’images pour l’entraînement d’algorithmes d’IA.


• Conception et mise en œuvre d’un protocole d’annotation du jeu d’images d’entraînement afin de créer un gold standard d’annotation.
  
  
  
  • Travail en étroite collaboration avec les chirurgiens du service d’orthopédie du CHUGA
  
  
  
  


• Conception et mise en œuvre d’un protocole d’évaluation de la performance de l’IA


• Exécution des tests unitaires de l’IA et évaluation sur les datasets de test selon le protocole établi précédemment.


• Capitalisation et documentation des résultats et des méthodes. d’évaluation de la qualité des jeux de données et des algorithmes d’IA.


• Gestion du projet avec les partenaires industriels et reporting auprès de l’équipe PREDIMED.

Profil souhaité

Compétences techniques

• Formation en ingénierie, orientée statistiques et machine learning


• Compétences dans l’exploitation de bases de données massives, structurées et non structurées


• Compétences en traitement d’image et/ou gestion de projet et communication


• Débutants acceptés

Savoir et Savoir-Faire

• Concevoir un jeu de données, entraîner et évaluer un algorithme d’IA en traitement d’images


• Exploiter des bases de données massives, structurées et non structurées


• Mener des analyses descriptives multivariées sur une population identifiée.


• Concevoir, rédiger une documentation technique


• Anglais technique


• Rendre compte de son travail et de ses avancées de manière synthétique 


• Connaissances du monde de la Santé, de son organisation, de ses enjeux éthiques et réglementaires en termes d’information de Santé

Savoir-être

• Dynamisme, rigueur, compétences relationnelles, initiative, autonomie, travail en équipe, communication.


• Être force de propositions à des problématiques (techniques, médico-légales, autres)

Informations du recruteur

Lieu de la mission