Data scientist / pharmaco-épidémiologiste

Description du poste et des missions

Présentation de la structure

La structure de recherche clinique APHP Centre Université Paris Cité est une structure mutualisée dédiée à la recherche clinique et à l’innovation dans les soins :

• Unité de Recherche Clinique pour l’aide à la promotion, l’aide méthodologique et l’accès aux big data


• Centre d’Investigation Clinique pour l’aide à l’investigation et l’aide méthodologique


• Pharmacologie biologique pour la pharmacocinétique et le dosage des médicaments


• Pharmacovigilance pour la prise en charge des effets indésirables

Mission générale 

Le data scientist / pharmaco-épidémiologiste collabore avec les investigateurs et les autres data scientist / biostatisticiens du GHU à tous les stades de l’exploitation de l’Entrepôt de Données de Santé de l’AP-HP et de la base de l’Assurance Maladie (SNDS): explicitation de la demande, mise au point du protocole de requêtage, réalisation de la requête, contrôle de la qualité des données, réalisation d'analyses, présentation des données, rédaction du rapport, diffusion des résultats. Il interagit avec l’équipe de développement de l’EDS pour garantir la fiabilité des processus d’extraction et d’alimentation de l’entrepôt.

Missions détaillées 

• Identification et construction de variables d’intérêt à partir de données massives issues de l’EDS et du SNDS, en concertation avec les médecins cliniciens, épidémiologistes et DIM. Participation au choix des nomenclatures, des sources de données externes et à la production du référentiel de données. Veille scientifique sur les méthodes informatiques et statistiques d’analyse des données massives ou non structurées


• Réalisation d’analyses statistiques sur données massives dont analyse de données longitudinales, de données censurées, datamining (sélection de variables, régularisation de modèle), analyse de trajectoires, modèles causaux, …


• Analyse méthodologique des études : analyse critique de la littérature, définition du plan expérimental, choix des critères de sélection et critères de jugement, modalités de recueil des données médicales et de suivi des patients, planification des analyses et calcul du nombre de sujets nécessaire


• Rédaction du rapport, aide à la valorisation et à l’écriture des articles : présentation des résultats et rédaction des parties méthodes et résultats des articles scientifiques, rédaction des rapports d’analyse.


• Mise en place de procédures de contrôle et d’assurance-qualité des données. Mise en place de bonnes pratiques d’usage de l’EDS


• Veille réglementaire


• Participation à la vie de l'URC et prise en charge des missions collectives ou transversales


• Participation aux évènement scientifiques de l’équipe de recherche


• Participation aux groupes de travail mis en place par la DRCI ou l'URC relevant de sa compétence


• Formation de ses collègues, animation de séminaire

Avanatgesde l'AP-HP

• Supplément Familial de traitement pour les parents avec enfant(s) à charge


• Remboursement partiel des titres de transports en commun en IDF.


• Accès à l’offre de formation continue de l’AP-HP


• Mise à disposition d’un ordinateur portable


• Accès à la cantine du personnel


• Autorisation d’absence pour évènements familiaux (enfant malade, mariage, décès...)


• Possibilité de place en crèche

Profil souhaité

Savoir-faire requis

• Formation en statistique, analyse de données et méthodologie de la recherche


• Méthodes et pratique en recherche clinique, épidémiologique, et en bases de données décisionnelles


• Maîtrise des principaux logiciels statistiques et de la programmation (R et/ou SAS, Python est également bienvenu)


• Connaître la législation relative à la recherche (Code Santé Publique), le traitement automatisé des données et la confidentialité (Informatique et Libertés, CNIL) ainsi que la réglementation (Bonnes Pratiques Cliniques)


• Savoir valider, interpréter et présenter les données


• Savoir juger de la qualité méthodologique des articles scientifiques

Connaissances associées

• Connaissance du milieu de la santé, du système d’information médico-administratif de l’AP-HP et national (SNDS)


• Connaissance de l’anglais


• Ethique et déontologie médicale de la recherche clinique

Savoir être requis

• Disponibilité


• Rigueur


• Curiosité intellectuelle


• Facilité de contact


• Aptitude à travailler en équipe 

Lieu de la mission